| Epidemiological Findings of Outbreaks of Disease Caused by Highly Pathogenic H5N1 Avian Influenza Virus in Poultry in Egypt During 2006 (2008) | |||||||||||
Abstract | |||||||||||
| This paper describes the first threats of H5N1 avian influenza outbreaks in Egypt recorded from February to December 2006 in commercial and domestic poultry from different species and summarizes the major characteristics of the outbreak. There were 1024 cases from different poultry species (rural and commercial chickens of different breeding types, turkeys, ducks, geese, and quail) either in commercial breeding or in backyards from different locations in Egypt. All tested positive for the H5N1 subtype. From these cases only 12 avian influenza A viruses were isolated and characterized from samples collected during outbreaks. All isolates were characterized, and the data confirmed that the isolated viruses belong to highly pathogenic avian influenza of subtype H5N1. Full hemagglutinin (HA) gene (segment 4) sequencing was also done, and the sequences of these isolates were compared with other strains from Russia, Africa, and the Middle East. The data revealed that all Egyptian strains were very closely related and belonging to subclade 2.2 of the H5N1 virus of Eurasian origin, the same one circulating in the Middle East region and introduced into Africa at the beginning of 2006. This study showed evidence of the wide spread of H5N1 virus infection in domestic poultry in Egypt within a short time. The most obvious features of these outbreaks were severe clinical signs and high mortalities as well as very rapid and widespread occurrence within the country in a very short time. The possible causes of its rapid spread and prospects of disease control are discussed.RESUMEN.Hallazgos epidemiológicos de brotes causados por virus de Influenza Aviar H5N1 de alta patogenicidad en aves comerciales en Egipto durante 2006.Este artículo describe las primeras amenazas del virus H5N1 de influenza aviar en Egipto en brotes registrados desde Febrero hasta Diciembre del año 2006 en aves comerciales y domésticas de diferentes especies y resume las principales características del brote. Se registraron 1024 casos de diferentes especies de aves (pollos rurales y comerciales, con diferentes métodos de crianza, pavos, patos, gansos, y codornices) tanto en cría comercial como en aves de traspatio de diferentes lugares en Egipto. Todas las pruebas realizadas fueron positivas para el subtipo H5N1. De estos casos solamente 12 virus de influenza tipo A fueron aislados y caracterizados a partir de las muestras tomadas durante los brotes. Todos los aislamientos fueron caracterizados y los datos confirmaron que los virus aislados pertenecían al subtipo H5N1 del virus de influenza aviar de alta patogenicidad. También se realizó la secuenciación completa del segmento 4 del gen de la proteína hemoaglutinina; las secuencias de estos aislamientos fueron comparados con otros virus de Rusia, Africa y el Medio Oriente. Los datos revelaron que todos los virus de Egipto estaban estrechamente relacionados y pertenecían al subgrupo 2.2 del virus H5N1 originado en Eurasia, el mismo que circula en la región del Medio Oriente e introducido en Africa en los inicios del año 2006. Este estudio mostró que la diseminación de la infección del virus H5N1 en aves domésticas en Egipto sucedió en un corto tiempo. Las características más obvias de estos brotes fueron signos clínicos severos y la presentación de alta mortalidad así como la rápida diseminación y ocurrencia dentro del país en un tiempo muy corto. También se discuten las posibles causas de la rápida diseminación y las perspectivas de control de la enfermedad.Abbreviations: AGID = agar gel immunodiffusion; H = hemagglutinin; HPAI = highly pathogenic avian influenza; LPAI = low-pathogenic avian influenza; NA = neuraminidase; NDV = Newcastle disease virus; OIE = World Organisation for Animal Health; PCR = polymerase chain reaction; PMV2 = paramyxovirus-2; PMV3 = paramyxovirus-3; RRT = real-time reverse transcription | |||||||||||
Publication details | |||||||||||
| |||||||||||