Arnaud Fontaine

Classification d'ARN codants et d'ARN non-codants (2009)

Fontaine, Arnaud

Les travaux présentés dans cette thèse s'inscrivent dans le cadre de l'analyse de phénomènes biologiques par des moyens informatiques, c'est-à-dire la bio-informatique. Nous nous intéressons...

Classification d'ARN codants et d'ARN non-codants (2009)

Fontaine, Arnaud

Les travaux présentés dans cette thèse s'inscrivent dans le cadre de l'analyse de phénomènes biologiques par des moyens informatiques, c'est-à-dire la bio-informatique. Nous nous intéressons...

Classification d'ARN codants et d'ARN non-codants (2009)

Fontaine, Arnaud

Les travaux présentés dans cette thèse s'inscrivent dans le cadre de l'analyse de phénomènes biologiques par des moyens informatiques, c'est-à-dire la bio-informatique. Nous nous intéressons...

Classification d'ARN codants et d'ARN non-codants (2009)

Fontaine, Arnaud

Les travaux présentés dans cette thèse s'inscrivent dans le cadre de l'analyse de phénomènes biologiques par des moyens informatiques, c'est-à-dire la bio-informatique. Nous nous intéressons...

NORINE: a database of nonribosomal peptides (2008)

Caboche, Ségolène, Pupin, Maude, Leclère, Valérie, Fontaine, Arnaud, Jacques, Philippe, Kucherov, Gregory

Norine is the first database entirely dedicated to nonribosomal peptides (NRPs). In bacteria and fungi, in addition to the traditional ribosomal proteic biosynthesis, an alternative...

MAGNOLIA: multiple alignment of protein-coding and structural RNA sequences (2008)

Fontaine, Arnaud, De Monte, Antoine, Touzet, Hélène

MAGNOLIA is a new software for multiple alignment of nucleic acid sequences, which are recognized to be hard to align. The idea is that the multiple alignment process should be improved by taking...

Graines espacées et recherche d’ARN non-codants (2007)

Arnaud Fontaine, Mathieu Giraud, Laurent Noé

Sequence comparison is widely used to help discovering novel non-coding RNAs in newly sequenced genomes. In this context, Blast-like homology search tools are of great interest. We show here that the...

How to detect non-coding RNAs ? (2005)

Arnaud Fontaine, Hélène Touzet

Structured non-coding RNAs have a very important functional role in the cell. They are involved in a variety of processes such as transcriptional and post-transcriptional regulation, chromosome...

Une Architecture pour les Services Télécom (2004)

Fontaine, Arnaud

Ce manuscrit se propose de mettre en exergue les mécanismes intervenant dans les problématiques de composition et de personnalisation de services télécoms, pour être en mesure de proposer une...

NORINE: a database of nonribosomal peptides

Caboche, Ségolène, Pupin, Maude, Leclère, Valérie, Fontaine, Arnaud, Jacques, Philippe, Kucherov, Gregory

Norine is the first database entirely dedicated to nonribosomal peptides (NRPs). In bacteria and fungi, in addition to the traditional ribosomal proteic biosynthesis, an alternative...

MAGNOLIA: multiple alignment of protein–coding and structural RNA sequences

Fontaine, Arnaud, De Monte, Antoine, Touzet, Hélène

MAGNOLIA is a new software for multiple alignment of nucleic acid sequences, which are recognized to be hard to align. The idea is that the multiple alignment process should be improved by taking...